Цирковирусные болезни свиней (ЦВБС) – комплекс заболеваний свиней с проявлением различных клинических признаков, вызываемых цирковирусом свиней второго типа (ЦВС-2). В этот комплекс входят синдром послеотъемного мультисистемного истощения (СПМИ), синдром дерматита и нефропатии свиней (СДНС), связанные с ЦВС-2 репродуктивные нарушения и респираторные болезни свиней. В настоящее время ЦВБС широко распространены в свиноводческих хозяйствах всего мира и причиняют значительный экономический ущерб в странах с развитым свиноводством.
Цирковирус свиней второго типа ЦВС-2 входит в состав рода Circovirus семейства Circoviridae. Вирионы цирковирусов – безоболочечные, икосаэдрической формы частицы диаметром от 16 до 22 нм. Капсид ЦВС-2 состоит из 32 капсомеров белка Cap. Геном ЦВС-2 представлен кольцевой одноцепочечной ДНК размером 1767–1768 нуклеотидов и кодирует как минимум пять белков. Основываясь на последовательности гена ORF2, кодирующем капсидный белок, изоляты ЦВС-2 разделены на восемь генотипов: ЦВС-2a – ЦВС-2h.
Целью настоящего исследования было изучение распространения и разнообразия изолятов ЦВС-2 в свиноводческих хозяйствах России.
Для обнаружения ДНК ЦВС-2 использовали коммерческие тест-системы на основе метода ПЦР в реальном времени. Для секвенирования геномов ЦВС-2 использовали разработанные нами четыре пары праймеров, позволяющие амплифицировать в ПЦР весь геном ЦВС-2. Нуклеотидные последовательности амплифицированных фрагментов определяли с помощью секвенирования по Сэнгеру. Полученные последовательности анализировали при помощи пакетов компьютерных программ LaserGene и Mega.
Были определены 14 полных нуклеотидных последовательностей ЦВС-2 из различных регионов России. Размер генома исследованных вирусов варьировал от 1767 до 1757 нуклеотидов, последовательность гена ORF2 702–705 нуклеотидов. Филогенетический анализ полученных последовательностей показал, что на территории России циркулируют вирусы трех из восьми известных генотипов ЦВС-2a, ЦВС-2b и ЦВС-2d. Доминирующим генотипом был ЦВС-2d.
Таким образом, мы провели исследование по изучению распространения и разнообразия изолятов цирковирусов свиней второго типа, циркулирующих на территории России. Выявлены три из восьми известных генотипов, доминирующим генотипом являлся ЦВС-2d. Эта работа важна для вирусологов, изучающих цирковирусы свиней, ветеринаров, работающих в промышленном свиноводстве, и разработчиков средств лечения и профилактики для животных.
Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда (проект № 19-16-00102).
Авторы: Антон Геннадиевич Южаков, Сергей Алексеевич Раев, Яна Борисовна Стрельцова, Виктория Васильевна Стаффорд, Алина Константиновна Комина, Тарас Иванович Алипер
ФГБНУ «Федеральный научный центр – Всероссийский научно исследовательский институт экспериментальной ветеринарии имени К. И. Скрябина и Я. Р. Коваленко Российской академии наук»
