Вопросы Л.А. Ильиной, к.б.н., начальнику молекулярно-генетической лаборатории ООО «Биотроф»:

А. Духовский: Вопрос касается выявления ключевого патогена. Если есть патологический процесс (например, диарея), позволяют ли ваши исследования указать на конкретный патоген или группу патогенов, причастных к этому синдрому?

Л.А. Ильина: Да, я как раз хотела бы вернуться в презентацию, к одному из первых слайдов (слайд 7). Разноцветные столбики отражают полный метагеномный анализ. Как правило, когда у нас возникают такие ситуации на предприятиях, к нам привозят образец содержимого кишечника или фекалий от свиней. Мы выделяем оттуда ДНК и проводим NGS-анализ. Методом NGS-секвенирования мы получаем полную раскладку по микроорганизмам. Каждый столбик — это отдельное животное, то есть мы видим, какой патоген может преобладать в данном случае, и выявить эти патогены.

А. Духовский: То есть это всё же прикидочные данные, мы о патогенности не можем рассуждать, это просто данность, факт. Вот эти патогены присутствуют, а их роль, патогенность, вирулентность нужно другими методами доказывать?

Л.А. Ильина: Да, конечно. Требуются дополнительные исследования. Это первичный скриннинг, который позволяет выявить доминирующий патоген и нарушения, которые имеются в микрофлоре, если они есть.

А. Духовский: Я думаю, практическое применение этому методу возможно при проведении сравнительных опытов, например, если одной группе давать антибиотики, а другой кормовые добавки, сравнивать группы по изменению микрофлоры и дальше уже рассуждать, произошел сдвиг в нужную сторону или нет, достаточен он или недостаточен.

Л.А.Ильина: Да, вы полностью правы, именно так мы пользуемся этими методиками в нашей жизни. Но, кроме того, многие предприятия обращаются к нам с вопросами выявления возможного патогена или контаминации какими-то патогенами кишечника. Могут быть разные направления дальнейших исследований.