Афонюшкин Василий: сообщение в ленте группы Секвенирование 5 лет назад
с одной стороны, это надежный метод подтверждения результатов ПЦР. Если сиквенс подтвердился то это позволяет исключить ложноположительные результаты, доказать что ПЦР среагировала не на вакцинный штамм.. На этом и все. Например, если была контаминация то сиквенс покажет что соответствующий кусочек РНК вируса РРСС в пробирку таки попал.. Наиболее надежно это ассоциативный анализ – оценка процента инфицированности и/или вирусной нагрузки у больных и здоровых животных одного возраста и , желательно, из одной группы… Тогда можно рассуждать о связи между вирусом РРСС и наличием проблем. Также следует учитывать что выявление вируса обычно производят высокочувствительной реакцией а вот для секвенирования берут другие куски генома и не всегда ПЦР проходит хорошо..